无菌室通过空气的净化和空间的消毒为微生物实验提供一个相对无菌的工作环境，无菌室是处理样品和接种培养的主要工作间，应与细菌检验操作室紧密相连。为满足无菌室无菌要求，无菌间应满足以下布局：

a.入口避开走廊，设在细菌检验操作室内；

b.与操作室用两道缓冲间隔开；

c.无菌室与缓冲间均装有紫外灯，要求每3平米安装30ｗ紫外灯一盏；

d.无菌室内设有实验台中央（实验台与边台皆可），紫外灯距实验台面要小于1.5m；

e.无菌室与操作室之间设有双层窗构成小通道。